《要塞密码战》将故事背景设定在1942年北非战役的关键节点。英军情报官艾略特因精通密码学被紧急调往一座被意军占据的沙漠要塞附近，任务是截获并破译德军刚启用的新型加密电报。他伪装成补给商人潜入当地小镇，与抵抗组织女翻译莱拉取得联系。两人在要塞外围一处废弃水井中架设监听设备，白天搜集信号，夜晚破译电文。随着密码逐步解开，艾略特发现德军正利用要塞地下一条废弃矿道囤积军火，并计划在盟军换防间隙发动突袭。然而莱拉的弟弟被意军扣押，她不得不在协助艾略特与保全家人之间挣扎。与此同时，要塞指挥官开始怀疑镇上有间谍，挨家搜查收音机与发报装置。艾略特与莱拉在暴露边缘完成最后一段密码破译，确认了突袭时间。他们必须在德军行动前将情报送出沙漠，而唯一的通道已被封锁。一场围绕密码、信任与牺牲的较量在要塞内外同时展开，每个人的选择都将决定这场战役的走向。